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乙脑是一种人畜共患的自然疫源性疾病。与人关系密切的猪、牛、马、羊、鸡、鸭等畜禽，均可因被蚊虫叮咬而感染乙脑。同时它们也是乙脑的传染源，即蚊子叮咬了这些有病的动物后再叮人，就可将乙脑传染给人类。因此，畜禽是乙脑的主要传染源。当人体被带有乙脑病毒的蚊子叮咬后，病毒就随着蚊子的唾液进入人体，经4-21天的潜伏期后，先在人体被咬处的细胞中生长繁殖，之后经血液到淋巴结等网状内皮系统中大量繁殖，然后再回到血液中形成病毒血症。人类感染乙脑后仅有较短的(约1周)的病毒血症期，而且血中的病毒含量也少，因而人类的乙脑患者不是乙脑的主要传染源。
乙脑患者多突然发病，潜伏期为4～21天，一般10左右。整个病程分为三期：
乙脑病毒是以蚊子为媒介而在禽畜和人类中相互传播的，所以乙脑患者也应该被隔离。不过对乙脑患者的隔离方法要与呼吸道传染病和消化道传染病患者有所不同。只要让乙脑患者到没有蚊子的环境中，或者用蚊帐将其罩起来，不让蚊子叮咬，那么乙脑患者体内的病毒就不会再传染给其他人了。
预防乙脑的关键是抓好灭蚊、防蚊、疫苗注射及对可传染乙脑动物的管理。具体做法如下：
1.灭蚊 重点控制稻田、大面积水坑蚊虫孽生；家畜圈舍喷洒杀虫剂进行灭蚊。
2. 防蚊 个人防护可用蚊帐、蚊香、驱蚊剂等，尽量避免被蚊虫叮咬。
3.保护易感人群最有效的措施是为该人群接种乙脑疫苗。对乙脑流行区内的儿童进行接种乙脑疫苗的方法是：一岁时应接种两次。两次接种之间应间隔1—2周;2岁、6岁和10岁时再各接种一次。由于人在接种乙脑疫苗一个月后，其体内的免疫力就会达到高峰，故预防接种工作应在乙脑流行期开始前一个月完成。
4.猪是乙脑病毒的主要宿主，要做好对猪、马等家畜的管理，对仔猪、仔马应注射谷用乙脑疫苗。
5.在夏秋之季，若发现高热不退、头痛、嗜睡的人，应想到其有患乙脑的可能，并应尽快将其送往医院诊治，不可麻痹大意，更不能让其乱服药。因为乙脑患者一旦延误了救治的时间，不仅会留下后遗症，甚至会造成更加严重的后果。
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